Web tabanlı muhasebe programları işletmelerin çağın gerekliliklerine uyum sağlayabilmelerini mümkün kılan esnekliğe sahiplerdir. Kullanımlarının kolay olmasının yanında, özelleştirilebilir bir yapıya da sahiplerdir. Şirketlerin tüm muhasebe süreçlerini tek bir ekran üzerinden yönetebilmelerini sağlar. Web tabanlı muhasebe programı ile elde edilebilecek en büyük avantaj, istenilen her yerden ve her cihazdan programa ulaşabilme rahatlığıdır. Bu sayede fatura hazırlama, gönderme, tahsilat yapma, barkod takibi gerçekleştirme, banka hesaplarını takip etme ve kasa takibi gibi tüm finansal süreçleri pratik bir şekilde yönetmek ve takip etmek mümkün olur. Web tabanlı muhasebe programlarının bir diğer avantajı da, verilerin çevrimiçi ortamda saklanıyor oluşudur. Böylece veriler her zaman güvende olur ve yangın gibi afetlerde veya hırsızlık gibi durumlarda veri kaybı yaşanmaz.